33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2021 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3698  levansucrase  75.65 
 
 
526 aa  759    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0822  levansucrase  72.08 
 
 
494 aa  733    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1010  levansucrase  72.53 
 
 
494 aa  731    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.450168  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0714  levansucrase  72.53 
 
 
494 aa  731    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4270  levansucrase  75.58 
 
 
527 aa  765    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169981  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0735  levansucrase  72.53 
 
 
494 aa  733    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1984  levansucrase  72.53 
 
 
494 aa  731    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3247  levansucrase  74.81 
 
 
527 aa  773    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.36332  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6116  levansucrase  67.64 
 
 
531 aa  678    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.116097 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4096  levansucrase  75.58 
 
 
527 aa  765    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0480075  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4171  levansucrase  75.65 
 
 
526 aa  759    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0733922  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1872  levansucrase  73.57 
 
 
509 aa  744    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2102  levansucrase precursor  72.46 
 
 
521 aa  729    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2021  levansucrase  100 
 
 
534 aa  1095    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00566302  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6047  levansucrase  74.66 
 
 
531 aa  772    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000164133  hitchhiker  0.00000266409 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0466  levansucrase  72.39 
 
 
521 aa  732    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1531  Levansucrase  65.57 
 
 
584 aa  654    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.515752  normal  0.219322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0405  levansucrase  57.65 
 
 
522 aa  553  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0616  Levansucrase  55.75 
 
 
532 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3405  Beta-fructofuranosidase  38.68 
 
 
473 aa  290  4e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.83791 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0032  levansucrase  37.81 
 
 
431 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0754  levansucrase  37.4 
 
 
431 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1453  levansucrase  37.4 
 
 
431 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2305  levansucrase  37.6 
 
 
415 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2103  levansucrase  36.78 
 
 
415 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962759  decreased coverage  0.00209256 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4097  Beta-fructofuranosidase  30.45 
 
 
451 aa  173  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1938  Levansucrase  32.49 
 
 
436 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2488  glycoside hydrolase family 68  30.35 
 
 
471 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0964  levansucrase  28.04 
 
 
385 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  25.13 
 
 
1009 aa  86.3  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  25.05 
 
 
1025 aa  81.6  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1879  levansucrase  25.69 
 
 
377 aa  77  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  24.03 
 
 
1002 aa  73.2  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>