33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1984 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3698  levansucrase  89.98 
 
 
526 aa  895    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0822  levansucrase  99.39 
 
 
494 aa  1011    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1010  levansucrase  100 
 
 
494 aa  1016    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.450168  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0714  levansucrase  100 
 
 
494 aa  1016    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4270  levansucrase  90.26 
 
 
527 aa  902    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169981  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0735  levansucrase  99.6 
 
 
494 aa  1013    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1984  levansucrase  100 
 
 
494 aa  1016    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3247  levansucrase  90.47 
 
 
527 aa  902    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.36332  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6116  levansucrase  72.19 
 
 
531 aa  713    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.116097 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4096  levansucrase  90.26 
 
 
527 aa  902    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0480075  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4171  levansucrase  89.98 
 
 
526 aa  895    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0733922  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1872  levansucrase  96.15 
 
 
509 aa  960    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2102  levansucrase precursor  100 
 
 
521 aa  1019    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2021  levansucrase  72.53 
 
 
534 aa  751    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00566302  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6047  levansucrase  87.73 
 
 
531 aa  866    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000164133  hitchhiker  0.00000266409 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0466  levansucrase  100 
 
 
521 aa  1020    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1531  Levansucrase  66.81 
 
 
584 aa  638    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.515752  normal  0.219322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0405  levansucrase  55.01 
 
 
522 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0616  Levansucrase  54.29 
 
 
532 aa  503  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3405  Beta-fructofuranosidase  41.28 
 
 
473 aa  309  6.999999999999999e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.83791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2305  levansucrase  37.87 
 
 
415 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0032  levansucrase  37.66 
 
 
431 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0754  levansucrase  37.23 
 
 
431 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1453  levansucrase  37.02 
 
 
431 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2103  levansucrase  36.81 
 
 
415 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962759  decreased coverage  0.00209256 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4097  Beta-fructofuranosidase  32.42 
 
 
451 aa  173  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2488  glycoside hydrolase family 68  32.21 
 
 
471 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1938  Levansucrase  32.59 
 
 
436 aa  156  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0964  levansucrase  26.59 
 
 
385 aa  117  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  26.74 
 
 
1009 aa  99.8  9e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  26.57 
 
 
1002 aa  99.4  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  25.75 
 
 
1025 aa  99.4  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1879  levansucrase  26.07 
 
 
377 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>