34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2305 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2305  levansucrase  100 
 
 		 415 aa  856    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0032  levansucrase  94.7 
 
 		 431 aa  820    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1453  levansucrase  94.7 
 
 		 431 aa  823    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0754  levansucrase  93.95 
 
 		 431 aa  815    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2103  levansucrase  94.7 
 
 		 415 aa  824    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962759  decreased coverage  0.00209256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3405  Beta-fructofuranosidase  44.07 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.83791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0616  Levansucrase  38.77 
 
 		 532 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0405  levansucrase  38.2 
 
 		 522 aa  272  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4096  levansucrase  39.52 
 
 		 527 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0480075  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3698  levansucrase  39.56 
 
 		 526 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4171  levansucrase  39.56 
 
 		 526 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0733922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4270  levansucrase  39.52 
 
 		 527 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169981  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3247  levansucrase  39.3 
 
 		 527 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.36332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6047  levansucrase  38.78 
 
 		 531 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000164133  hitchhiker  0.00000266409 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1872  levansucrase  37.99 
 
 		 509 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0735  levansucrase  38.46 
 
 		 494 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0822  levansucrase  38.46 
 
 		 494 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0466  levansucrase  38.24 
 
 		 521 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1010  levansucrase  38.24 
 
 		 494 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.450168  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2102  levansucrase precursor  38.24 
 
 		 521 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6116  levansucrase  39.82 
 
 		 531 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.116097 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1984  levansucrase  38.24 
 
 		 494 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0714  levansucrase  38.24 
 
 		 494 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2021  levansucrase  37.6 
 
 		 534 aa  259  8e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00566302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1531  Levansucrase  39.04 
 
 		 584 aa  259  9e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.515752  normal  0.219322 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4097  Beta-fructofuranosidase  34.8 
 
 		 451 aa  229  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2488  glycoside hydrolase family 68  36 
 
 		 471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1938  Levansucrase  34.49 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0964  levansucrase  29.21 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1879  levansucrase  30.49 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1025 aa  85.5  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1002 aa  82  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1009 aa  79.7  0.00000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3850  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.89 
 
 		 319 aa  43.5  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0183549  normal  0.803751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>