61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00880 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  100 
 
 		 478 aa  971    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  44.02 
 
 		 502 aa  373  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  48.26 
 
 		 2495 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  48.53 
 
 		 613 aa  188  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  49 
 
 		 651 aa  167  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  43.9 
 
 		 811 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  47.96 
 
 		 377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  44.38 
 
 		 750 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  42.08 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  47.02 
 
 		 330 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  39.59 
 
 		 550 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  43.6 
 
 		 807 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  38.91 
 
 		 602 aa  145  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  40.52 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  38.27 
 
 		 817 aa  142  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  43.01 
 
 		 532 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  60.17 
 
 		 302 aa  139  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  40.19 
 
 		 753 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  38.36 
 
 		 454 aa  133  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  33.95 
 
 		 592 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  51.22 
 
 		 440 aa  131  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  42.11 
 
 		 512 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  38.22 
 
 		 342 aa  129  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  35.79 
 
 		 316 aa  127  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  40.56 
 
 		 552 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  31.91 
 
 		 891 aa  119  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  35.89 
 
 		 434 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  36.4 
 
 		 331 aa  118  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  40.76 
 
 		 573 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  36.41 
 
 		 1732 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  38.86 
 
 		 757 aa  110  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  41.46 
 
 		 578 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  35.14 
 
 		 1557 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  38.71 
 
 		 465 aa  101  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  56.25 
 
 		 203 aa  94.4  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  34.34 
 
 		 1131 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  34.34 
 
 		 1131 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  33.13 
 
 		 697 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.14 
 
 		 762 aa  82.8  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  36.13 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  34.95 
 
 		 1514 aa  80.1  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  30.15 
 
 		 2821 aa  78.2  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  31.1 
 
 		 737 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  32.11 
 
 		 1527 aa  73.9  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.13 
 
 		 339 aa  73.2  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  30.6 
 
 		 1475 aa  68.2  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  39.76 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  26.44 
 
 		 587 aa  67  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.8 
 
 		 268 aa  66.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00636935  normal  0.0253427 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  27.96 
 
 		 890 aa  65.1  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  28.45 
 
 		 1363 aa  60.8  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  25.37 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  27.81 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  29.14 
 
 		 184 aa  53.9  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  25.78 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1025 aa  47.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  27.39 
 
 		 532 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1002 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1009 aa  45.8  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>