55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05190 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  100 
 
 
440 aa  870    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  44.44 
 
 
750 aa  167  5e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  62.5 
 
 
811 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  42.35 
 
 
592 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  47.52 
 
 
651 aa  137  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  52.1 
 
 
502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  51.22 
 
 
478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  51.22 
 
 
613 aa  129  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  45.45 
 
 
2495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  43.1 
 
 
807 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  47.93 
 
 
330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  48.31 
 
 
602 aa  116  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  44.26 
 
 
430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  39.5 
 
 
454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  41.78 
 
 
753 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  41.8 
 
 
550 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  42.06 
 
 
302 aa  99.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  42.64 
 
 
532 aa  98.6  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  38.26 
 
 
324 aa  98.6  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  39.6 
 
 
512 aa  97.1  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  36.13 
 
 
1732 aa  96.3  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  34.3 
 
 
342 aa  90.9  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  37.4 
 
 
377 aa  89  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  38.06 
 
 
757 aa  87.8  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  46.88 
 
 
203 aa  88.2  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  34.04 
 
 
465 aa  87  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  41.84 
 
 
331 aa  87  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  38.24 
 
 
817 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  29.8 
 
 
1557 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  42.11 
 
 
578 aa  82  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  39.2 
 
 
552 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  37.39 
 
 
891 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  36.55 
 
 
316 aa  77  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  33.79 
 
 
573 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  34.38 
 
 
1131 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  34.38 
 
 
1131 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.05 
 
 
762 aa  69.3  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  31.91 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  47.89 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  33.59 
 
 
697 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  33.65 
 
 
737 aa  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  35.77 
 
 
271 aa  63.2  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.48 
 
 
339 aa  60.8  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  33.33 
 
 
2821 aa  58.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  29.56 
 
 
1527 aa  56.2  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  33.87 
 
 
1025 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  32.5 
 
 
1002 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  32.5 
 
 
1009 aa  52.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  31.3 
 
 
1363 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  29.92 
 
 
589 aa  49.7  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  33.59 
 
 
1514 aa  47.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.07 
 
 
268 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00636935  normal  0.0253427 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  31.4 
 
 
420 aa  43.9  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  28.16 
 
 
587 aa  43.9  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  28.69 
 
 
1475 aa  43.5  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>