85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0535 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0535  YG repeat-containing cell wall-associated hydrolase  100 
 
 
292 aa  598  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1786  YG repeat-containing cell wall-associated hydrolase  60.4 
 
 
303 aa  249  5e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  41.94 
 
 
1732 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1016  NlpC/P60 family protein  33.61 
 
 
446 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000775164  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  31.06 
 
 
450 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  30.83 
 
 
388 aa  52.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  42.35 
 
 
502 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  34.31 
 
 
393 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  28.38 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  33.63 
 
 
370 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  33.98 
 
 
578 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  33.61 
 
 
338 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  32.74 
 
 
363 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  35.11 
 
 
807 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  30.97 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  36.23 
 
 
592 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  45 
 
 
532 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  31.25 
 
 
341 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  30.97 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  30.97 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  30.58 
 
 
419 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  40.91 
 
 
602 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  31.67 
 
 
598 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  50.91 
 
 
651 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  31.67 
 
 
582 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  30 
 
 
378 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  30.28 
 
 
454 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  36.11 
 
 
430 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  32.74 
 
 
363 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  33.01 
 
 
361 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  29.82 
 
 
350 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  33.01 
 
 
361 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  30.94 
 
 
230 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  33.04 
 
 
454 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  43.1 
 
 
203 aa  46.2  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.19 
 
 
580 aa  45.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  31.19 
 
 
579 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  30.09 
 
 
378 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  29.75 
 
 
434 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  38.2 
 
 
342 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  27.45 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  28.08 
 
 
205 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  28.57 
 
 
495 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  30.5 
 
 
221 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  31.37 
 
 
582 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  29.27 
 
 
234 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  29.49 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  30.36 
 
 
582 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  30.77 
 
 
173 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  33.01 
 
 
162 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  30.5 
 
 
241 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  25.4 
 
 
420 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  37.36 
 
 
811 aa  44.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  30.5 
 
 
241 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  32.67 
 
 
342 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  32.67 
 
 
342 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  30.39 
 
 
240 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  33.75 
 
 
578 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  29.58 
 
 
228 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  29.81 
 
 
452 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  31.34 
 
 
465 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  28.12 
 
 
234 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  32.04 
 
 
181 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  31.19 
 
 
154 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  27.34 
 
 
208 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  38.33 
 
 
613 aa  43.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  30.25 
 
 
204 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  33.93 
 
 
532 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  27.34 
 
 
269 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  40 
 
 
316 aa  43.1  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  30.39 
 
 
575 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  28.12 
 
 
249 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  27.34 
 
 
249 aa  43.1  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  27.34 
 
 
249 aa  43.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  30.77 
 
 
577 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5301  endopeptidase lytE, putative  30.25 
 
 
513 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  32.38 
 
 
227 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  33.05 
 
 
388 aa  42.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  26.21 
 
 
178 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  30.95 
 
 
1131 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  26.36 
 
 
424 aa  42.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  31.43 
 
 
587 aa  42.4  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  30.95 
 
 
1131 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  30 
 
 
341 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  45.45 
 
 
550 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>