40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1094 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  100 
 
 		 399 aa  813    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  95.74 
 
 		 399 aa  782    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  43.3 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  41.56 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.49 
 
 		 514 aa  172  5.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0022042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  42.11 
 
 		 1363 aa  145  9e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  38.92 
 
 		 532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  56.58 
 
 		 184 aa  97.4  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  31.79 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  24.76 
 
 		 454 aa  63.2  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  28 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1135  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.79 
 
 		 1248 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00817868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1112  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase., mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  29.79 
 
 		 1248 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00229916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3407  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.49 
 
 		 351 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000173531  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  25 
 
 		 512 aa  54.3  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  26.4 
 
 		 1527 aa  53.9  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  25.11 
 
 		 891 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  23.76 
 
 		 589 aa  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2581  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.38 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000866464  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0636  bifunctional autolysin  27.78 
 
 		 1335 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000166594  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  23 
 
 		 757 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  25.53 
 
 		 430 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  25 
 
 		 478 aa  50.4  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  28.24 
 
 		 316 aa  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  28.57 
 
 		 552 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  24.43 
 
 		 550 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  33.66 
 
 		 750 aa  47.4  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  26.23 
 
 		 697 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  24.41 
 
 		 651 aa  47.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  25.27 
 
 		 613 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  27.7 
 
 		 1131 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  27.7 
 
 		 1131 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  29.09 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  30.39 
 
 		 753 aa  45.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  27.75 
 
 		 2821 aa  44.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  26.26 
 
 		 342 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  28.67 
 
 		 2495 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  22.69 
 
 		 1557 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  26.04 
 
 		 602 aa  43.1  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  24.51 
 
 		 330 aa  43.1  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>