69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0592 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  100 
 
 		 891 aa  1790    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  43.58 
 
 		 807 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  54.61 
 
 		 552 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  66.82 
 
 		 434 aa  300  6e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  52.54 
 
 		 573 aa  291  4e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3120  S-layer domain protein  36.82 
 
 		 627 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  30.4 
 
 		 620 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4398  S-layer protein  30.4 
 
 		 620 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740229  hitchhiker  0.00000000000010382 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  41.41 
 
 		 330 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0784  S-layer domain-containing protein  29.9 
 
 		 620 aa  172  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000163217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  33.64 
 
 		 615 aa  171  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000356588  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  35.53 
 
 		 651 aa  148  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  38.5 
 
 		 613 aa  145  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  38.11 
 
 		 532 aa  140  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  35.89 
 
 		 602 aa  139  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  35.45 
 
 		 550 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  37.56 
 
 		 430 aa  133  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  34.8 
 
 		 454 aa  132  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 753 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  37.68 
 
 		 512 aa  121  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  31.91 
 
 		 478 aa  119  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  35.55 
 
 		 2495 aa  117  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  32.72 
 
 		 750 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  34.85 
 
 		 324 aa  116  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 757 aa  114  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  38.56 
 
 		 502 aa  114  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  31.62 
 
 		 316 aa  111  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  35.79 
 
 		 811 aa  106  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  34.47 
 
 		 592 aa  99  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  30.26 
 
 		 817 aa  95.5  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  36.09 
 
 		 302 aa  95.5  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  35.27 
 
 		 342 aa  90.9  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 377 aa  91.3  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  32.79 
 
 		 331 aa  88.2  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  28.99 
 
 		 1131 aa  84.3  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  28.99 
 
 		 1131 aa  84.3  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  28.67 
 
 		 1557 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  39.83 
 
 		 578 aa  80.1  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  29.21 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  32.41 
 
 		 697 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27 
 
 		 762 aa  78.2  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  37.39 
 
 		 440 aa  77  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1431  S-layer domain-containing protein  35.86 
 
 		 458 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3449  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.49 
 
 		 843 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  36.27 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0787  mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosamidase  38.02 
 
 		 234 aa  67.4  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  25.89 
 
 		 589 aa  65.9  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  26.05 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2837  S-layer protein  36.43 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122747  hitchhiker  0.0000000116253 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 		 792 aa  64.3  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2476  S-layer protein  36.43 
 
 		 472 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.612094  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  36.23 
 
 		 1732 aa  63.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1629  S-layer protein  35.85 
 
 		 470 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00040233  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  27.5 
 
 		 737 aa  62.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.39 
 
 		 339 aa  62.8  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1863  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  35.86 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27744e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1683  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.86 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00306779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1818  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.86 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000545238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1890  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.52 
 
 		 470 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00294488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1939  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  35.22 
 
 		 470 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000781755  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  42.11 
 
 		 203 aa  59.3  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  25.69 
 
 		 890 aa  55.5  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.93 
 
 		 399 aa  52.8  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.11 
 
 		 399 aa  52.4  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  28.11 
 
 		 1527 aa  52  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  28.07 
 
 		 587 aa  51.2  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0909  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  27.63 
 
 		 632 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0927  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  27.63 
 
 		 632 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  29.79 
 
 		 2821 aa  45.8  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>