71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0891 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 762 aa  1558    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  44.35 
 
 		 890 aa  249  1e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  24.82 
 
 		 1557 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  27.03 
 
 		 2821 aa  120  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  26.61 
 
 		 602 aa  116  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  29.56 
 
 		 651 aa  109  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  34.22 
 
 		 613 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.16 
 
 		 386 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.16 
 
 		 386 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1454  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.3 
 
 		 156 aa  98.6  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0480002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  28.12 
 
 		 573 aa  97.4  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  35.78 
 
 		 330 aa  92.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  28.32 
 
 		 753 aa  93.2  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  32.6 
 
 		 502 aa  91.7  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  29.64 
 
 		 331 aa  90.1  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  28.65 
 
 		 324 aa  89.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  25.25 
 
 		 757 aa  89.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  31.48 
 
 		 552 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  26.11 
 
 		 550 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  23.39 
 
 		 1514 aa  82.8  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  43.14 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  43.56 
 
 		 750 aa  82.4  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  36.17 
 
 		 807 aa  81.6  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  41 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  34.13 
 
 		 434 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  27.89 
 
 		 316 aa  79.3  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  32.58 
 
 		 512 aa  78.6  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  32.95 
 
 		 811 aa  78.2  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  27 
 
 		 891 aa  78.2  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  34.44 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  33.54 
 
 		 377 aa  76.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  28.81 
 
 		 737 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  36.7 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  41.07 
 
 		 1131 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  41.07 
 
 		 1131 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  31.72 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  37.5 
 
 		 2495 aa  70.1  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  34.68 
 
 		 697 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  32.24 
 
 		 592 aa  69.7  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  39.05 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  30.26 
 
 		 817 aa  65.5  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  41.56 
 
 		 203 aa  65.5  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  24.35 
 
 		 1527 aa  62.4  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  40.54 
 
 		 578 aa  62.4  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  30.05 
 
 		 1732 aa  62  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1844  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.89 
 
 		 218 aa  60.5  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  24.91 
 
 		 350 aa  60.1  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  38.55 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  23.13 
 
 		 1475 aa  58.5  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0079  hypothetical protein  30.71 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  23.92 
 
 		 587 aa  56.6  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6152  hypothetical protein  31.15 
 
 		 264 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  0.0289624 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1014  hypothetical protein  30.07 
 
 		 190 aa  55.8  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00318676  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.66 
 
 		 261 aa  55.5  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0727  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.4 
 
 		 653 aa  53.9  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0726  hypothetical protein  36.29 
 
 		 210 aa  53.9  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0464  hypothetical protein  26.97 
 
 		 228 aa  52.4  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.767953 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.39 
 
 		 339 aa  52  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  21.26 
 
 		 532 aa  50.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  23.11 
 
 		 1363 aa  49.7  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0633  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.57 
 
 		 253 aa  48.9  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  34.15 
 
 		 271 aa  48.1  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1684  hypothetical protein  42.86 
 
 		 446 aa  48.1  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271172 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  26.29 
 
 		 589 aa  47.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.69 
 
 		 332 aa  45.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2364  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.45 
 
 		 270 aa  45.4  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0212469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2205  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.65 
 
 		 204 aa  45.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1237  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.17 
 
 		 184 aa  45.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3286  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 		 251 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0799688  normal  0.416162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.32 
 
 		 260 aa  44.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>