27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1844 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1844  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 218 aa  456  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1684  hypothetical protein  60.26 
 
 		 446 aa  194  7e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271172 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0464  hypothetical protein  51.32 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.767953 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0726  hypothetical protein  43.06 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1014  hypothetical protein  35.98 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00318676  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0079  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.45 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.54 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.95 
 
 		 386 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.89 
 
 		 762 aa  60.5  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  31.43 
 
 		 574 aa  53.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0727  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.15 
 
 		 653 aa  50.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.08 
 
 		 249 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2205  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.72 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  28.19 
 
 		 507 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2404  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25 
 
 		 112 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  24.03 
 
 		 532 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09580  Ykud domain-containing protein  24.43 
 
 		 514 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00711473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8763  hypothetical protein  25.85 
 
 		 303 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1258  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.2 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.818065  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1973  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.13 
 
 		 277 aa  42  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2045  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1454  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 		 156 aa  42  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0480002  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.63 
 
 		 605 aa  41.6  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1671  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  23.91 
 
 		 441 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0578  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.39 
 
 		 228 aa  41.6  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6758  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.21 
 
 		 381 aa  41.6  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>