84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0028 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 386 aa  781    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  94.04 
 
 		 386 aa  737    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.16 
 
 		 762 aa  101  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0079  hypothetical protein  38.69 
 
 		 235 aa  101  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1684  hypothetical protein  37.86 
 
 		 446 aa  87.8  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271172 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1454  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.94 
 
 		 156 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0480002  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0727  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.45 
 
 		 653 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0726  hypothetical protein  36.15 
 
 		 210 aa  82.4  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.48 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0464  hypothetical protein  32.88 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.767953 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1844  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.95 
 
 		 218 aa  75.5  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1014  hypothetical protein  37.04 
 
 		 190 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00318676  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  34.11 
 
 		 532 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1784  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.4 
 
 		 236 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.909249  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  28 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.4 
 
 		 257 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  40 
 
 		 507 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.41 
 
 		 272 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  27.14 
 
 		 574 aa  50.4  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  27.22 
 
 		 588 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0968  hypothetical protein  28.57 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000162984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1134  hypothetical protein  28.57 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258795  hitchhiker  0.0000968229 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01888  hypothetical protein  30.15 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.014746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1638  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.383508  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2272  hypothetical protein  28.57 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000409269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2113  hypothetical protein  28.57 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.00781e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2835  hypothetical protein  30.15 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  normal  0.833391 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.15 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00191568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01899  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  30.15 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0819  hypothetical protein  29.71 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.53 
 
 		 216 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  28.1 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0668  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.55 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  27.91 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  28.81 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.81 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  28.81 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.76 
 
 		 171 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  28.93 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  29.17 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.4 
 
 		 171 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  30.58 
 
 		 330 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2404  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.83 
 
 		 112 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4524  hypothetical protein  28.99 
 
 		 253 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0816159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  27.2 
 
 		 575 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  22.38 
 
 		 503 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  26.45 
 
 		 537 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2123  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.15 
 
 		 219 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0656  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.41 
 
 		 253 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  24.79 
 
 		 520 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0969  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.85 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000011509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0664  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.67 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0476  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.76 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000432617  unclonable  0.00000802452 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3103  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.43 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  24.79 
 
 		 503 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.2 
 
 		 155 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0611  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.11 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0825  hypothetical protein  26.67 
 
 		 253 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2602e-53 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.41 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.74 
 
 		 230 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000150825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.93 
 
 		 289 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  25.34 
 
 		 568 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  27.27 
 
 		 536 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6152  hypothetical protein  36.96 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  0.0289624 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1450  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.12 
 
 		 178 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000594458  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0913  hypothetical protein  28.15 
 
 		 253 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.6 
 
 		 177 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1258  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.54 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.818065  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09580  Ykud domain-containing protein  24.62 
 
 		 514 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00711473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28770  hypothetical protein  31.82 
 
 		 399 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.132574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  23.77 
 
 		 206 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2911  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.43 
 
 		 284 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.514235  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  25.62 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.61 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1698  hypothetical protein  30.15 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.41368e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.36 
 
 		 217 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.91 
 
 		 605 aa  43.5  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.19 
 
 		 345 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2997  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.43 
 
 		 282 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4815  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.11 
 
 		 217 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60436 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0448  hypothetical protein  25.87 
 
 		 315 aa  42.7  0.01  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.63 
 
 		 866 aa  42.7  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  28.46 
 
 		 418 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>