46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09580 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09580  Ykud domain-containing protein  100 
 
 		 514 aa  1045    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00711473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41 
 
 		 498 aa  359  8e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00199371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.92 
 
 		 492 aa  341  2e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.379639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2208  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.84 
 
 		 552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.827056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03640  Ykud domain-containing protein  35.07 
 
 		 521 aa  320  3e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0846  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.59 
 
 		 559 aa  219  7e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.203875 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1420  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.37 
 
 		 470 aa  124  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0040  hypothetical protein  25.92 
 
 		 464 aa  99  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1698  hypothetical protein  28.63 
 
 		 417 aa  94.4  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.41368e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2030  hypothetical protein  23.19 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.533222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3224  hypothetical protein  22.98 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2989  hypothetical protein  22.04 
 
 		 482 aa  87.4  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3238  hypothetical protein  22.25 
 
 		 481 aa  87  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2927  hypothetical protein  22.8 
 
 		 482 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3232  hypothetical protein  21.67 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3259  hypothetical protein  22.03 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0365241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3002  hypothetical protein  21.67 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0878761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3256  hypothetical protein  22.17 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.218487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2947  hypothetical protein  28.07 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0687281  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  23.96 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4125  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.62 
 
 		 201 aa  71.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.793652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.61 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.29 
 
 		 866 aa  57.4  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  23.64 
 
 		 574 aa  55.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  34.38 
 
 		 330 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.69 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  30 
 
 		 536 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  29.37 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  28.46 
 
 		 503 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.89 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.34 
 
 		 177 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  28.36 
 
 		 455 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.31 
 
 		 256 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.3 
 
 		 397 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.3 
 
 		 398 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  31.54 
 
 		 496 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  27.61 
 
 		 519 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2614  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.56 
 
 		 388 aa  47  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000221676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  26.98 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  28.79 
 
 		 408 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  28.79 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  29.1 
 
 		 568 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  26.87 
 
 		 520 aa  44.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4281  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.75 
 
 		 628 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.62 
 
 		 386 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.38 
 
 		 386 aa  43.5  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>