32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0464 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0464  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.767953 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1684  hypothetical protein  59.56 
 
 
446 aa  221  6e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271172 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1844  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.66 
 
 
218 aa  177  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0726  hypothetical protein  50 
 
 
210 aa  154  8e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1014  hypothetical protein  36.54 
 
 
190 aa  122  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00318676  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0079  hypothetical protein  36.81 
 
 
235 aa  111  8.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.94 
 
 
261 aa  102  7e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.88 
 
 
386 aa  81.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.88 
 
 
386 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0727  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.53 
 
 
653 aa  62  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.97 
 
 
762 aa  52.8  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.47 
 
 
257 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.46 
 
 
155 aa  48.5  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1454  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.38 
 
 
156 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0480002  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.87 
 
 
206 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.87 
 
 
171 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.92 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.36 
 
 
170 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2205  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.04 
 
 
204 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4195  LysM domain-containing protein  38.89 
 
 
303 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.543729  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  27.86 
 
 
507 aa  42.4  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00803  hypothetical protein  53.12 
 
 
306 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0843  hypothetical protein  53.12 
 
 
306 aa  42.4  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2529  hypothetical protein  53.12 
 
 
306 aa  42.4  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.990181  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00786  hypothetical protein  53.12 
 
 
306 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2824  hypothetical protein  53.12 
 
 
306 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0889  hypothetical protein  53.12 
 
 
306 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.479275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0876  hypothetical protein  53.12 
 
 
306 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.12 
 
 
306 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0968  hypothetical protein  53.12 
 
 
304 aa  42.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.495532  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  27.78 
 
 
519 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  51.85 
 
 
574 aa  42  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>