59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16000 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  100 
 
 		 316 aa  622  1e-177  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  50.61 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  39.04 
 
 		 651 aa  173  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  41.94 
 
 		 2495 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  35.77 
 
 		 613 aa  151  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 602 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  34.02 
 
 		 550 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  38.78 
 
 		 502 aa  143  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  36.55 
 
 		 532 aa  142  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  42.54 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  38.22 
 
 		 807 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  34.19 
 
 		 552 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  37.55 
 
 		 512 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  35.9 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  32.34 
 
 		 573 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  35.5 
 
 		 430 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  34.57 
 
 		 757 aa  123  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  34.56 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  36.07 
 
 		 478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  33.12 
 
 		 1557 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  34.15 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  31.76 
 
 		 891 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  37.56 
 
 		 592 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  29.88 
 
 		 434 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  32.99 
 
 		 753 aa  109  7.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  40.12 
 
 		 811 aa  107  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  32.46 
 
 		 750 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  45.38 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.13 
 
 		 762 aa  89.7  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  25.59 
 
 		 697 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  32.12 
 
 		 440 aa  82.4  0.000000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  25.66 
 
 		 1131 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  25.66 
 
 		 1131 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  33.92 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  29.8 
 
 		 2821 aa  80.9  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  32.92 
 
 		 817 aa  80.5  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  34.29 
 
 		 1732 aa  77.8  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  43.12 
 
 		 578 aa  74.3  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  30.24 
 
 		 890 aa  68.6  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  27.37 
 
 		 589 aa  65.5  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  26.32 
 
 		 1514 aa  65.1  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  40.24 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  27.21 
 
 		 1527 aa  63.5  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.73 
 
 		 339 aa  62.4  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  31.14 
 
 		 465 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  26.94 
 
 		 737 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  28.43 
 
 		 587 aa  58.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  26.48 
 
 		 1475 aa  57.4  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  27.94 
 
 		 474 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  25.37 
 
 		 1363 aa  53.9  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  34.58 
 
 		 350 aa  53.5  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  36.59 
 
 		 271 aa  52.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  32.09 
 
 		 184 aa  52.8  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.8 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  25.1 
 
 		 420 aa  50.1  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.29 
 
 		 399 aa  49.3  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0535  YG repeat-containing cell wall-associated hydrolase  43.84 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.18 
 
 		 437 aa  43.9  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1573  metallo-beta-lactamase family protein  24.12 
 
 		 626 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>