26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0559 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0559  trans-sialidase  100 
 
 		 331 aa  648    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0558  hypothetical protein  83.95 
 
 		 243 aa  379  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.362885 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf462  hypothetical lipoprotein  56.63 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000141923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  63.46 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3223  OmpA/MotB domain-containing protein  67.92 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.943443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1258  hypothetical protein  45.92 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3628  hypothetical protein  45.92 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  65.22 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  65.22 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1806  hypothetical protein  31.36 
 
 		 685 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3674  hypothetical protein  46.15 
 
 		 459 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1151  hypothetical protein  45.83 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  37.93 
 
 		 285 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1160  hypothetical protein  41.94 
 
 		 566 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0788241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1372  hypothetical protein  46.75 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  40.66 
 
 		 1441 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  61.82 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  61.82 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  52.33 
 
 		 623 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  61.82 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  61.82 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5847  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.59 
 
 		 425 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  54.88 
 
 		 848 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  42.31 
 
 		 1014 aa  43.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  55.1 
 
 		 719 aa  42.7  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.06 
 
 		 275 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>