23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0558 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0558  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  485  1e-136  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.362885 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0559  trans-sialidase  83.54 
 
 
331 aa  364  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  70.83 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  68.18 
 
 
240 aa  55.5  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  68.18 
 
 
240 aa  55.5  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3223  OmpA/MotB domain-containing protein  54.1 
 
 
441 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.943443 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf462  hypothetical lipoprotein  50.6 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000141923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1258  hypothetical protein  57.81 
 
 
355 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3628  hypothetical protein  56.92 
 
 
331 aa  53.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1151  hypothetical protein  51.47 
 
 
350 aa  48.5  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  51.39 
 
 
285 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1806  hypothetical protein  39.44 
 
 
685 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  39.08 
 
 
1441 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  66.67 
 
 
275 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  56.86 
 
 
275 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1372  hypothetical protein  42.31 
 
 
344 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  62.79 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  59.26 
 
 
275 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3674  hypothetical protein  45 
 
 
459 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  57.41 
 
 
275 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  57.41 
 
 
275 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  57.41 
 
 
275 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  57.41 
 
 
275 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>