38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3628 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1258  hypothetical protein  99.4 
 
 		 355 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3628  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  671    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1151  hypothetical protein  97.58 
 
 		 350 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3652  hypothetical protein  53.99 
 
 		 290 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1225  hypothetical protein  45.7 
 
 		 278 aa  225  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3050  hypothetical protein  44.88 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2769  hypothetical protein  39.38 
 
 		 252 aa  182  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1084  hypothetical protein  44.78 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3040  hypothetical protein  40.89 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.177948 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1113  putative lipoprotein  46.12 
 
 		 237 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02411  hypothetical protein  46.12 
 
 		 237 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2708  hypothetical protein  46.12 
 
 		 239 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2920  hypothetical protein  46.12 
 
 		 239 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.999465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02447  hypothetical protein  46.12 
 
 		 237 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1122  hypothetical protein  46.12 
 
 		 237 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2708  hypothetical protein  45.63 
 
 		 237 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2840  hypothetical protein  45.63 
 
 		 239 aa  166  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3789  hypothetical protein  48.91 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2939  hypothetical protein  42.79 
 
 		 228 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2722  hypothetical protein  43.75 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2764  hypothetical protein  42.79 
 
 		 228 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2826  hypothetical protein  42.79 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2805  hypothetical protein  42.79 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0558  hypothetical protein  48.98 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.362885 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0559  trans-sialidase  46.94 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf462  hypothetical lipoprotein  41.07 
 
 		 228 aa  57  0.0000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000141923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  43.75 
 
 		 245 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  42.5 
 
 		 240 aa  50.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  42.5 
 
 		 240 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3223  OmpA/MotB domain-containing protein  50.85 
 
 		 441 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.943443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  35.58 
 
 		 1441 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1806  hypothetical protein  31.94 
 
 		 685 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4076  hypothetical protein  46.58 
 
 		 589 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  46.43 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  37.7 
 
 		 778 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  40.28 
 
 		 1459 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1372  hypothetical protein  43.24 
 
 		 344 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  39.76 
 
 		 816 aa  42.7  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>