17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1372 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1372  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4532  hypothetical protein  34.67 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0874  hypothetical protein  38.71 
 
 		 246 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234526  normal  0.535466 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0762  hypothetical protein  62.12 
 
 		 211 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0958  hypothetical protein  39.29 
 
 		 258 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.571715  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3265  hypothetical protein  33.79 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3589  hypothetical protein  32.88 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  30.2 
 
 		 3472 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  30.2 
 
 		 3471 aa  59.3  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf462  hypothetical lipoprotein  41.04 
 
 		 228 aa  53.1  0.000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000141923  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.02 
 
 		 775 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3461  putative exported protein of unknown function  30.3 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0559  trans-sialidase  49.09 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  27 
 
 		 2179 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  27.74 
 
 		 3409 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  26.72 
 
 		 2449 aa  43.9  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0558  hypothetical protein  50 
 
 		 243 aa  42.7  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.362885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>