24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50390 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  100 
 
 
623 aa  1140    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47779  predicted protein  69.9 
 
 
622 aa  325  1e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  96.26 
 
 
848 aa  181  4.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf462  hypothetical lipoprotein  58.65 
 
 
228 aa  108  2e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000141923  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  42.36 
 
 
497 aa  85.1  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  44.44 
 
 
2313 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4569  hypothetical protein  41.32 
 
 
495 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0942693  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1257  hypothetical protein  60 
 
 
297 aa  66.2  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  44.1 
 
 
1000 aa  65.1  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  61.84 
 
 
2397 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5847  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.38 
 
 
425 aa  62  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  96.67 
 
 
808 aa  58.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48565  predicted protein  40.17 
 
 
648 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767614  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  43.64 
 
 
590 aa  51.2  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3812  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  37.21 
 
 
449 aa  50.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.458595 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1954  hypothetical protein  38.95 
 
 
517 aa  50.8  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.960644  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0559  trans-sialidase  50.46 
 
 
331 aa  50.4  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00819  hypothetical protein  25 
 
 
823 aa  48.9  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6344  hypothetical protein  47.62 
 
 
196 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126188  decreased coverage  0.0000382354 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0874  60S ribosomal protein L19  43.9 
 
 
304 aa  48.1  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  41.9 
 
 
875 aa  47.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  40.98 
 
 
2449 aa  47  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2564  hypothetical protein  29.27 
 
 
350 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3223  OmpA/MotB domain-containing protein  42.27 
 
 
441 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.943443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>