27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1954 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1954  hypothetical protein  100 
 
 		 517 aa  1048    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.960644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1844  hypothetical protein  93.81 
 
 		 492 aa  973    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2381  putative virulence effector protein  47.13 
 
 		 461 aa  403  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2093  putative virulence effector protein  70.89 
 
 		 465 aa  243  7.999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1882  putative virulence effector protein  51.97 
 
 		 452 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2102  putative virulence effector protein  44.55 
 
 		 442 aa  229  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1435  putative virulence effector protein  42.86 
 
 		 402 aa  216  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1773  ssrAB activated gene  58.23 
 
 		 439 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1748  ssrAB activated gene  58.23 
 
 		 442 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.135386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1567  ssrAB activated gene  58.23 
 
 		 439 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1711  ssrAB activated gene  58.23 
 
 		 441 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2108  ssrAB activated gene  56.25 
 
 		 460 aa  202  9e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1708  ssrAB activated gene  57.59 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0471  hypothetical protein  55.7 
 
 		 454 aa  196  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4240  hypothetical protein  54.55 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0163273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52100  hypothetical protein  51.23 
 
 		 486 aa  171  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1846  hypothetical protein  41.4 
 
 		 524 aa  131  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.378193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2633  hypothetical protein  37.36 
 
 		 451 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.270397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2870  hypothetical protein  38.29 
 
 		 509 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457968  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3155  hypothetical protein  28.37 
 
 		 513 aa  77  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0450583  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0896  hypothetical protein  29.22 
 
 		 421 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.08458  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1312  hypothetical protein  35 
 
 		 436 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00429215  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  33.83 
 
 		 848 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1966  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.38 
 
 		 578 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  60 
 
 		 1364 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  31.91 
 
 		 597 aa  47  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  44.59 
 
 		 623 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>