35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3155 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3155  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1013    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0450583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1846  hypothetical protein  28.88 
 
 		 524 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.378193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52100  hypothetical protein  31.64 
 
 		 486 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2093  putative virulence effector protein  33.73 
 
 		 465 aa  90.9  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1435  putative virulence effector protein  31.78 
 
 		 402 aa  90.5  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2381  putative virulence effector protein  32.95 
 
 		 461 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4240  hypothetical protein  30.3 
 
 		 465 aa  85.9  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0163273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0471  hypothetical protein  31.65 
 
 		 454 aa  81.3  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2633  hypothetical protein  28.97 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.270397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2870  hypothetical protein  31.9 
 
 		 509 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457968  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1882  putative virulence effector protein  30.43 
 
 		 452 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1773  ssrAB activated gene  32.65 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1748  ssrAB activated gene  32.65 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.135386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1567  ssrAB activated gene  32.65 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1708  ssrAB activated gene  32.65 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1711  ssrAB activated gene  32.65 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2102  putative virulence effector protein  30.22 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1954  hypothetical protein  28.37 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.960644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1844  hypothetical protein  28.37 
 
 		 492 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2108  ssrAB activated gene  28.97 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1312  hypothetical protein  29.86 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00429215  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  41.96 
 
 		 2449 aa  61.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5007  hypothetical protein  30.16 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.26972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  33.06 
 
 		 3409 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  37.04 
 
 		 2179 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  38.27 
 
 		 2272 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  34.82 
 
 		 3471 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  34.82 
 
 		 3472 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  32.69 
 
 		 3521 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  41.67 
 
 		 2136 aa  51.6  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4049  hypothetical protein  31.97 
 
 		 233 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.502434  normal  0.0734559 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  33.33 
 
 		 1859 aa  45.8  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  35.29 
 
 		 607 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  33.77 
 
 		 1888 aa  43.9  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6479  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.38 
 
 		 739 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>