24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2108 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2108  ssrAB activated gene  100 
 
 
460 aa  929    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1567  ssrAB activated gene  64.01 
 
 
439 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1773  ssrAB activated gene  64.01 
 
 
439 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420884  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1748  ssrAB activated gene  63.71 
 
 
442 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.135386  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1711  ssrAB activated gene  63.93 
 
 
441 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1708  ssrAB activated gene  63.71 
 
 
441 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.483925  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2381  putative virulence effector protein  42.45 
 
 
461 aa  345  7e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1882  putative virulence effector protein  42.32 
 
 
452 aa  345  8.999999999999999e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2102  putative virulence effector protein  43.6 
 
 
442 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1435  putative virulence effector protein  39.22 
 
 
402 aa  307  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2093  putative virulence effector protein  60.13 
 
 
465 aa  209  7e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1954  hypothetical protein  56.25 
 
 
517 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.960644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1844  hypothetical protein  56.25 
 
 
492 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0471  hypothetical protein  50 
 
 
454 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4240  hypothetical protein  53.25 
 
 
465 aa  170  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0163273  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2633  hypothetical protein  27.76 
 
 
451 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.270397  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52100  hypothetical protein  40.94 
 
 
486 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1846  hypothetical protein  40.62 
 
 
524 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.378193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2870  hypothetical protein  34.83 
 
 
509 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457968  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3155  hypothetical protein  29.58 
 
 
513 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0450583  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0896  hypothetical protein  29.13 
 
 
421 aa  47.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.08458  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1312  hypothetical protein  32.65 
 
 
436 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00429215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6479  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.8 
 
 
739 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  25.44 
 
 
597 aa  43.9  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>