More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1966 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1966  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 578 aa  1134    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4050  hypothetical protein  41.44 
 
 		 629 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35522  normal  0.114627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3157  hypothetical protein  31.09 
 
 		 405 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.842057  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1311  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.49 
 
 		 386 aa  101  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000182  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0895  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.74 
 
 		 621 aa  89.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.693546  normal  0.575051 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2398  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.48 
 
 		 531 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2284  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.82 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3423  protein kinase  33.68 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3130  putative serine protease  30.09 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0656366  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3344  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.4 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  31.79 
 
 		 497 aa  62  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3867  forkhead-associated protein  30.09 
 
 		 404 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  30.57 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  31.82 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  28.71 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.37 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  29.29 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0713  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.73 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.8 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12621  hypothetical protein  32.78 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.95 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0559  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.71 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.2 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 545 aa  57.4  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  36.59 
 
 		 375 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  31.89 
 
 		 374 aa  56.6  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  29.09 
 
 		 503 aa  56.6  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.14 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.29 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.28 
 
 		 506 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0403  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.25 
 
 		 551 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000492986  n/a   
 
 
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  30.99 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  35.37 
 
 		 413 aa  56.2  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.8 
 
 		 674 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  28.31 
 
 		 373 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  28.31 
 
 		 357 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 403 aa  55.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  31.43 
 
 		 411 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1716  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.43 
 
 		 280 aa  55.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.319195 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1846  hypothetical protein  27.54 
 
 		 524 aa  54.7  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.378193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  26.03 
 
 		 394 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  31.18 
 
 		 423 aa  54.3  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  31.98 
 
 		 485 aa  54.7  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1379  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.12 
 
 		 495 aa  54.7  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.49 
 
 		 428 aa  54.3  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  31.58 
 
 		 525 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  30.06 
 
 		 475 aa  54.3  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  29.27 
 
 		 370 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  29.58 
 
 		 399 aa  53.9  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  28.57 
 
 		 388 aa  53.9  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.71 
 
 		 372 aa  53.5  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  29.05 
 
 		 525 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.81 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  30.69 
 
 		 464 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  28.1 
 
 		 397 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  26.18 
 
 		 382 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2702  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.12 
 
 		 366 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.351014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  29.61 
 
 		 347 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1248  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.89 
 
 		 287 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.490271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  28.1 
 
 		 383 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.64 
 
 		 474 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52100  hypothetical protein  29.09 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.2 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  35.37 
 
 		 344 aa  52.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3020  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.64 
 
 		 324 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.64 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  30.28 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.69 
 
 		 417 aa  52.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1523  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.1 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.415135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  28.63 
 
 		 489 aa  52  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1324  2-alkenal reductase  31.64 
 
 		 469 aa  52  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  31.55 
 
 		 402 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  31.55 
 
 		 402 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  30.64 
 
 		 474 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.69 
 
 		 366 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.68 
 
 		 387 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  31.18 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  27.4 
 
 		 459 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  29.59 
 
 		 400 aa  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_907  serine protease, DegP/HtrA family  25.57 
 
 		 377 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000696598  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.98 
 
 		 544 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.71 
 
 		 916 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  31.91 
 
 		 583 aa  51.6  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  32.14 
 
 		 471 aa  51.6  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  31.46 
 
 		 511 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  34.73 
 
 		 381 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  26.15 
 
 		 377 aa  51.6  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.65 
 
 		 381 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  34.13 
 
 		 381 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1037  serine protease  26.03 
 
 		 373 aa  51.2  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0643787  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.98 
 
 		 481 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  28.14 
 
 		 379 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.98 
 
 		 484 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  34.73 
 
 		 381 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.32 
 
 		 318 aa  51.2  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  30.06 
 
 		 420 aa  51.2  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  26.46 
 
 		 368 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0037  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.58 
 
 		 307 aa  50.8  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  32.12 
 
 		 409 aa  50.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  32.12 
 
 		 468 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>