More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1311 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1311  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 386 aa  761    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000182  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4050  hypothetical protein  36.61 
 
 		 629 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35522  normal  0.114627 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0895  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.67 
 
 		 621 aa  109  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.693546  normal  0.575051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3157  hypothetical protein  34.19 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.842057  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1966  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.94 
 
 		 578 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.31 
 
 		 513 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2398  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.09 
 
 		 531 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.71 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3130  putative serine protease  30.42 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0656366  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  31.66 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  33.71 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2284  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.47 
 
 		 514 aa  67  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  32.18 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  33.16 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  34.36 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3867  forkhead-associated protein  30 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  32.57 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  32.57 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  32.57 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  32.57 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  33.14 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  32.57 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  32.57 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  32.57 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  34.44 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  33.68 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  33.13 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  34.32 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  34.02 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  35.15 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  33.14 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  31.82 
 
 		 494 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  33.33 
 
 		 500 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1248  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.1 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.490271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  30.26 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  32.57 
 
 		 503 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  32.27 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  33.16 
 
 		 509 aa  62.8  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  31.5 
 
 		 496 aa  62.8  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  31.12 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  30.85 
 
 		 492 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  31.82 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  35.15 
 
 		 373 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  32.14 
 
 		 528 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  35.15 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  31.82 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  31.12 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  31.82 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12621  hypothetical protein  32.59 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  31.82 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  36.88 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  31.82 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  33.51 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.72 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  30.85 
 
 		 477 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  29.44 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  31.11 
 
 		 494 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  31.82 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  31.61 
 
 		 484 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  32.83 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  30.56 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  31.25 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.82 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  34.72 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  34.72 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  32.16 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  32.8 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  31.31 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2025  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.22 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.591638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  37.14 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  33.87 
 
 		 516 aa  60.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0798  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  30.89 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  32.16 
 
 		 498 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3423  protein kinase  32.61 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  37.71 
 
 		 503 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  32.97 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1392  protease Do  30.77 
 
 		 493 aa  60.1  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.66 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  31.76 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  30.57 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  31.43 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  32.16 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  30.35 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  28.71 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  33.33 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  33.71 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  31.63 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.12 
 
 		 916 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  33.33 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  33.7 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  31.87 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  30.81 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  35.71 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  31.72 
 
 		 511 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1446  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.57 
 
 		 845 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0617491  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  31.09 
 
 		 507 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  31.02 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  31.32 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  31.94 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>