98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3157 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3157  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  806    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.842057  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4050  hypothetical protein  38.54 
 
 		 629 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35522  normal  0.114627 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0895  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.19 
 
 		 621 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.693546  normal  0.575051 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1966  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 578 aa  104  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1311  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.97 
 
 		 386 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000182  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2398  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.8 
 
 		 531 aa  73.6  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3130  putative serine protease  32.29 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0656366  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2284  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.61 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3867  forkhead-associated protein  31.84 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3423  protein kinase  30.7 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  31.96 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.64 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  33.49 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  33.49 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  34.38 
 
 		 374 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  34.42 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  32.02 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  34.42 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  32.83 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  32.02 
 
 		 442 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0103  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.89 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  28.2 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  29.35 
 
 		 855 aa  50.8  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.11 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1313  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.35 
 
 		 264 aa  50.1  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.95 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.56 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  29.82 
 
 		 500 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  31.96 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12621  hypothetical protein  29.07 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  34.36 
 
 		 508 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.72 
 
 		 426 aa  47  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  29.81 
 
 		 373 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  29.81 
 
 		 357 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  29.24 
 
 		 501 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1446  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.81 
 
 		 845 aa  46.6  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0617491  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.21 
 
 		 439 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  31.67 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  29.88 
 
 		 480 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.71 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  31.9 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  29.38 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  32.18 
 
 		 526 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  32.52 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  31.76 
 
 		 537 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  30 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  33.33 
 
 		 381 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.98 
 
 		 513 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  32.72 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  28.65 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  31.28 
 
 		 496 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  33.33 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  31.93 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  28.65 
 
 		 506 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0713  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  26.79 
 
 		 487 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  27 
 
 		 490 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  32.32 
 
 		 485 aa  45.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  25.56 
 
 		 512 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  26.5 
 
 		 492 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  31.95 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  26.5 
 
 		 492 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.33 
 
 		 674 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  35.44 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.75 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  28.43 
 
 		 528 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  30.95 
 
 		 528 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.89 
 
 		 524 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  31.29 
 
 		 498 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0403  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.38 
 
 		 551 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000492986  n/a   
 
 
 
NC_013124  Afer_0559  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.95 
 
 		 487 aa  43.9  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3046  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.81 
 
 		 284 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.933946  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  31.76 
 
 		 473 aa  43.5  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  32.32 
 
 		 485 aa  43.9  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  28.75 
 
 		 462 aa  43.5  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  29.78 
 
 		 520 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1397  glutamyl endopeptidase precursor SspA  25.71 
 
 		 282 aa  43.5  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.01 
 
 		 487 aa  43.5  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  30.22 
 
 		 523 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  31.36 
 
 		 518 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.54 
 
 		 289 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.447417 
 
 
-
 
NC_002950  PG0840  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1343 aa  43.5  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0269599 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  32.96 
 
 		 516 aa  43.5  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  27.98 
 
 		 483 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.82 
 
 		 386 aa  43.5  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  27.98 
 
 		 483 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  31.77 
 
 		 474 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.06 
 
 		 426 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2452  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.9 
 
 		 358 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.767281  normal  0.478055 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15600  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  28.93 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0395297  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.33 
 
 		 506 aa  43.1  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  30.59 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  31.84 
 
 		 523 aa  43.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2049  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.95 
 
 		 275 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.718333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  30.72 
 
 		 527 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  29.7 
 
 		 489 aa  43.1  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  30.49 
 
 		 482 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  31.25 
 
 		 474 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>