More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1446 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1446  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 845 aa  1714    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0617491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0500  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.68 
 
 		 347 aa  114  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.16 
 
 		 379 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.94 
 
 		 707 aa  104  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.500481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  37.43 
 
 		 393 aa  99.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  37.06 
 
 		 508 aa  95.9  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  38.37 
 
 		 504 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  42.5 
 
 		 383 aa  95.9  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.14 
 
 		 415 aa  95.5  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3710  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.43 
 
 		 394 aa  94.7  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0810  2-alkenal reductase  40.54 
 
 		 487 aa  93.2  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.810469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  38.75 
 
 		 382 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  34.12 
 
 		 772 aa  92.8  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  38.99 
 
 		 373 aa  92.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  38.33 
 
 		 357 aa  92.8  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  38.46 
 
 		 497 aa  92  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  38.15 
 
 		 502 aa  92  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  35.96 
 
 		 459 aa  92  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.47 
 
 		 426 aa  91.7  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  39.36 
 
 		 368 aa  91.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  35.84 
 
 		 485 aa  91.3  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  35.29 
 
 		 522 aa  91.3  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  42.35 
 
 		 494 aa  91.3  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  42.35 
 
 		 495 aa  90.9  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  33.99 
 
 		 370 aa  90.9  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  42.35 
 
 		 494 aa  90.1  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  41.76 
 
 		 493 aa  90.5  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  39.35 
 
 		 424 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1392  protease Do  36.16 
 
 		 493 aa  90.5  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  36.16 
 
 		 537 aa  90.5  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  37.79 
 
 		 504 aa  90.1  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  35.23 
 
 		 501 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  41.36 
 
 		 453 aa  90.1  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  37.85 
 
 		 462 aa  90.1  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  41.76 
 
 		 493 aa  90.1  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.28 
 
 		 545 aa  89.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  38.15 
 
 		 514 aa  89.7  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  38.15 
 
 		 514 aa  89.7  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.33 
 
 		 316 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  41.76 
 
 		 493 aa  90.1  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  39.63 
 
 		 469 aa  89.7  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  36.31 
 
 		 459 aa  90.1  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  28.46 
 
 		 444 aa  89  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0372  PDZ/DHR/GLGF  41.61 
 
 		 377 aa  89  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  32.26 
 
 		 584 aa  89.4  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  41.76 
 
 		 494 aa  89.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  36.36 
 
 		 442 aa  89  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  41.76 
 
 		 494 aa  89.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  38.71 
 
 		 402 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  35.45 
 
 		 372 aa  88.6  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  41.36 
 
 		 453 aa  89  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2412  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.11 
 
 		 268 aa  88.6  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  34.52 
 
 		 264 aa  89  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  39.64 
 
 		 504 aa  88.2  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  39.35 
 
 		 402 aa  88.2  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  39.35 
 
 		 402 aa  88.2  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  38.41 
 
 		 552 aa  88.6  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  36.79 
 
 		 456 aa  88.6  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  39.64 
 
 		 503 aa  88.6  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.8 
 
 		 318 aa  88.6  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12621  hypothetical protein  35.43 
 
 		 459 aa  88.6  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  41.76 
 
 		 483 aa  88.2  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3140  putative serine protease protein  38.12 
 
 		 305 aa  88.2  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  41.76 
 
 		 495 aa  88.2  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  41.76 
 
 		 495 aa  88.2  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  39.05 
 
 		 500 aa  88.2  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  36.63 
 
 		 489 aa  88.2  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  41.76 
 
 		 495 aa  88.2  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  35.38 
 
 		 370 aa  88.2  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  41.76 
 
 		 495 aa  88.2  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  30.6 
 
 		 455 aa  88.2  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  41.76 
 
 		 483 aa  88.2  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  41.76 
 
 		 483 aa  88.2  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  33.73 
 
 		 487 aa  87.8  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1306  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.43 
 
 		 415 aa  87.8  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692323  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  39.24 
 
 		 501 aa  87.8  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.5 
 
 		 428 aa  87  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.36 
 
 		 423 aa  87.4  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.3 
 
 		 487 aa  87.4  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  38.46 
 
 		 471 aa  87  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.35 
 
 		 428 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  38.16 
 
 		 400 aa  87  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  35.78 
 
 		 575 aa  87  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  35.71 
 
 		 508 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  36.27 
 
 		 455 aa  87.4  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  38.61 
 
 		 492 aa  87  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  35.22 
 
 		 524 aa  86.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  31.65 
 
 		 583 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  36.61 
 
 		 375 aa  86.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  34.59 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.8 
 
 		 319 aa  86.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.9 
 
 		 474 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  33.53 
 
 		 473 aa  86.7  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.47 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  40.85 
 
 		 451 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  41.1 
 
 		 500 aa  86.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.75 
 
 		 405 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.85 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  37.89 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  35.75 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>