24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1257 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1257  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0345  hypothetical protein  45.1 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  59.65 
 
 
1014 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  40.74 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  60.71 
 
 
848 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  23.44 
 
 
1612 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  60 
 
 
623 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  47.27 
 
 
379 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  47.27 
 
 
379 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  49.06 
 
 
383 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5847  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.27 
 
 
425 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  39.62 
 
 
567 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3112  hypothetical protein  50.91 
 
 
636 aa  45.8  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0225252  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  44.23 
 
 
778 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  35.85 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  46.05 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  35.85 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  35.85 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  35.85 
 
 
292 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26190  hypothetical protein  52.63 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105599  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0343  hypothetical protein  30.39 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3329  hypothetical protein  30.43 
 
 
624 aa  43.1  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1946  hypothetical protein  52.63 
 
 
491 aa  42.7  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
719 aa  42.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>