10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0343 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0343  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  594  1e-169  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0345  hypothetical protein  45.63 
 
 
279 aa  187  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0342  hypothetical protein  30.53 
 
 
263 aa  102  9e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0344  hypothetical protein  35.68 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  70.73 
 
 
287 aa  57.4  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  68.57 
 
 
270 aa  49.7  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0334  hypothetical protein  32.86 
 
 
343 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0351  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
553 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1257  hypothetical protein  30.39 
 
 
297 aa  43.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1522  hypothetical protein  28.24 
 
 
236 aa  43.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000116972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>