34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1405 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  88.98 
 
 
379 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  88.98 
 
 
379 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  88.25 
 
 
383 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  67.25 
 
 
327 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  62.17 
 
 
300 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  60 
 
 
299 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  60 
 
 
299 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  60.53 
 
 
305 aa  322  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  78.28 
 
 
301 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  74.87 
 
 
297 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  44.03 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  43.53 
 
 
322 aa  225  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  40.43 
 
 
320 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  60.47 
 
 
228 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  37.8 
 
 
276 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  56.62 
 
 
253 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  53.19 
 
 
266 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  51.88 
 
 
274 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  51.95 
 
 
266 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  46.67 
 
 
264 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  48.2 
 
 
278 aa  139  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  47.69 
 
 
265 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  51.56 
 
 
278 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  44.44 
 
 
260 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  48.87 
 
 
221 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  39.57 
 
 
253 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  39.51 
 
 
259 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  42.96 
 
 
276 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  73.24 
 
 
300 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1257  hypothetical protein  24.83 
 
 
297 aa  52.8  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>