28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3329 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3329  hypothetical protein  100 
 
 		 624 aa  1186    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1946  hypothetical protein  47.25 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3112  hypothetical protein  46.75 
 
 		 636 aa  57.4  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0225252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  38.82 
 
 		 719 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6458  hypothetical protein  40.91 
 
 		 9529 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2345  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4095  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00617588  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4083  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0538175  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4033  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000656142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3833  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3389  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141638  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3382  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182437  hitchhiker  0.00538438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3274  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000259909  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2390  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.082083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1873  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00916179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1477  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136224  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1383  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000158375  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1221  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000020949  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0834  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000820934  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0751  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000459793  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0635  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000109907  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0539  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0478326  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0302  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0247  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186858  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0157  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00114927  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0101  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000553926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  24.3 
 
 		 383 aa  44.3  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2920  hypothetical protein  38.89 
 
 		 762 aa  43.9  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>