39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2253 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  96.34 
 
 		 379 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  744    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  96.34 
 
 		 379 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  88.25 
 
 		 341 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  88.25 
 
 		 341 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  88.25 
 
 		 341 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  85.63 
 
 		 292 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  60.68 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  78.79 
 
 		 300 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  71.43 
 
 		 300 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  77.89 
 
 		 301 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  74.37 
 
 		 299 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  74.37 
 
 		 299 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  79.89 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  66.81 
 
 		 305 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  61.7 
 
 		 311 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  67.41 
 
 		 322 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  61.49 
 
 		 320 aa  179  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  60 
 
 		 228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  51.57 
 
 		 276 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  56.62 
 
 		 253 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  53.19 
 
 		 266 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  51.88 
 
 		 274 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  50.94 
 
 		 266 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  46.67 
 
 		 264 aa  139  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  49.25 
 
 		 278 aa  139  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  51.56 
 
 		 278 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  47.69 
 
 		 265 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  44.44 
 
 		 260 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  48.87 
 
 		 221 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  40.83 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  37 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  42.96 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1257  hypothetical protein  49.06 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  32.41 
 
 		 971 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  46.15 
 
 		 1014 aa  53.5  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1212  hypothetical protein  59.09 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3329  hypothetical protein  24.3 
 
 		 624 aa  43.5  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  42.31 
 
 		 249 aa  42.7  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>