49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4687 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  100 
 
 		 264 aa  543  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  43.14 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  42.05 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  40.89 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  40.65 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  40 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  38.01 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  36.74 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  59.15 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  47.3 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  35.27 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 322 aa  161  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  36.76 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  33.54 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  35.47 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.9 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  49.63 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  33.45 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  33.45 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  33.67 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  33.66 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  34.5 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  50 
 
 		 341 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  50 
 
 		 341 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  45.22 
 
 		 327 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  50 
 
 		 341 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  50 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  50 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  50 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  33.22 
 
 		 301 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  50.38 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  32.48 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  44.78 
 
 		 311 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  22.65 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2076  putative transmembrane anti-sigma factor  26.92 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000018802  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  24.82 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3851  putative anti-sigma factor  28.91 
 
 		 221 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  30.2 
 
 		 277 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  27.12 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  23.05 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  23.64 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  23.64 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.72 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  27.31 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2782  putative transmembrane anti-sigma factor  25.67 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0804  hypothetical protein  18.52 
 
 		 188 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  23.44 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  23.44 
 
 		 275 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1813  putative transmembrane anti-sigma factor  32.56 
 
 		 248 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000268109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>