41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0389 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 259 aa  507  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  49.45 
 
 		 276 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  36.25 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  34.5 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  37.45 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  35.52 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  32.71 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  32.43 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  34.19 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  33.2 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  42.24 
 
 		 221 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  33.47 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  41.09 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  42.11 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  40.56 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  41.79 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  41.79 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  41.79 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  41.79 
 
 		 383 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  41.79 
 
 		 292 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  41.79 
 
 		 379 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  39.04 
 
 		 327 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  41.79 
 
 		 379 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  40.15 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  38.52 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  38.52 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  38.52 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  36.55 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  40.15 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  37.67 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  36.5 
 
 		 320 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  37.98 
 
 		 322 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  27.4 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  29.59 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  26.86 
 
 		 250 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  29.44 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  27.97 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  26.82 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  26.19 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  26.82 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0826  putative transmembrane anti-sigma factor  25.79 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00528212  hitchhiker  0.000460261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>