35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1812 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 301 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  94.35 
 
 		 300 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  79.73 
 
 		 300 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  76.08 
 
 		 297 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  77.89 
 
 		 299 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  77.89 
 
 		 299 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  74.76 
 
 		 305 aa  371  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  62.8 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  63.27 
 
 		 341 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  63.27 
 
 		 341 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  63.27 
 
 		 341 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  61.56 
 
 		 292 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  75.12 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  75.12 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  50.31 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  73.85 
 
 		 383 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  51.56 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  50.32 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  42.62 
 
 		 266 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  44.44 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  45.17 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  47.08 
 
 		 228 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  33.45 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  34.9 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  39.45 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  34.78 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  34.69 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  33.8 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  54.01 
 
 		 253 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  36.58 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  46.27 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  45.45 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  31.96 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1210  anti-sigma factor  39.71 
 
 		 107 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  38.46 
 
 		 376 aa  42.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>