41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0910 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 322 aa  653    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  53.12 
 
 		 311 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  52.41 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  50.16 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  50.47 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  50.32 
 
 		 299 aa  254  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  50.32 
 
 		 299 aa  254  9e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  47.73 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  49.23 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  47.55 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  45.65 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  44.02 
 
 		 341 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  44.02 
 
 		 341 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  44.02 
 
 		 341 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  66.67 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  66.67 
 
 		 383 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  66.67 
 
 		 379 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  66.67 
 
 		 379 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  38.71 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  39.14 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  39.1 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  33.33 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  32.46 
 
 		 265 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  41.26 
 
 		 228 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  34.22 
 
 		 260 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.46 
 
 		 253 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  31.86 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  49.23 
 
 		 278 aa  135  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  45.56 
 
 		 221 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  46.67 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  40.58 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  28 
 
 		 259 aa  95.9  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  30.73 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  28.29 
 
 		 271 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0624  hypothetical protein  33.82 
 
 		 85 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  27.54 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  27.54 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2153  hypothetical protein  33.82 
 
 		 85 aa  43.5  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  28.93 
 
 		 257 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5341  putative transmembrane anti-sigma factor  32.89 
 
 		 268 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>