14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5341 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5341  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 268 aa  543  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  29.3 
 
 		 276 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  30.95 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  30.98 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  31.35 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2633  putative transmembrane anti-sigma factor  35.65 
 
 		 169 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  25.74 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  23.53 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  26.32 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  31.53 
 
 		 336 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  23.76 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2018  putative transmembrane anti-sigma factor  27.47 
 
 		 384 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0764  putative transmembrane anti-sigma factor  32.31 
 
 		 88 aa  43.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  32.88 
 
 		 322 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>