27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1488 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 
276 aa  551  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  64.18 
 
 
271 aa  311  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  65.67 
 
 
271 aa  308  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  65.67 
 
 
271 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5341  putative transmembrane anti-sigma factor  29.3 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612653  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  27.08 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  25.93 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  22.65 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  22.78 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  27.44 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  24.3 
 
 
278 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  28.48 
 
 
274 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  25.09 
 
 
266 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  22.22 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  24.81 
 
 
264 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  28.29 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2249  putative transmembrane anti-sigma factor  29.63 
 
 
412 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  27.74 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2633  putative transmembrane anti-sigma factor  33.96 
 
 
169 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  25.52 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  28.23 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  29.17 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0131  putative transmembrane anti-sigma factor  26.88 
 
 
347 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000144677  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  27.31 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  25.93 
 
 
276 aa  42.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  26.94 
 
 
255 aa  42.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  25.37 
 
 
265 aa  42  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>