58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2675 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  100 
 
 		 253 aa  518  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  68.46 
 
 		 260 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  39.53 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  40 
 
 		 264 aa  185  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  37.31 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  37.59 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  43.8 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  39.54 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  37.6 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  35.5 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  45.12 
 
 		 221 aa  148  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  34.32 
 
 		 276 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  32.7 
 
 		 327 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  31.46 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.93 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  34.13 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  33.8 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  33.8 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  33.45 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  43.07 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  30.99 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  32.53 
 
 		 301 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  45.38 
 
 		 383 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  45.38 
 
 		 341 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  45.38 
 
 		 379 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  45.38 
 
 		 379 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  45.38 
 
 		 341 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  45.38 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  45.38 
 
 		 341 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  34.69 
 
 		 276 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  40 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  33.47 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  27.1 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  30.85 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  22.78 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  24.31 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  24.31 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  24.31 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  37.68 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3398  putative transmembrane anti-sigma factor  25.86 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.745464  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  26.97 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  34.78 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  24.62 
 
 		 268 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  25.64 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  29.1 
 
 		 275 aa  45.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  29.1 
 
 		 275 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  28.33 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  26.09 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  24.32 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0151  putative transmembrane anti-sigma factor  28.05 
 
 		 203 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1998  putative transmembrane anti-sigma factor  32.14 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  27.68 
 
 		 329 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3851  putative anti-sigma factor  29.46 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2782  putative transmembrane anti-sigma factor  22.35 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  23.66 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1703  putative transmembrane anti-sigma factor  32.84 
 
 		 75 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.864451  hitchhiker  0.000407329 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0982  hypothetical protein  35.56 
 
 		 327 aa  42  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>