17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1703 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1703  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 75 aa  154  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.864451  hitchhiker  0.000407329 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0758  putative transmembrane anti-sigma factor  61.64 
 
 		 78 aa  91.7  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.163321 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0624  hypothetical protein  58.57 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2153  hypothetical protein  54.29 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0764  putative transmembrane anti-sigma factor  57.14 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0867  putative transmembrane anti-sigma factor  54.29 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.71952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1890  hypothetical protein  49.32 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  27.94 
 
 		 376 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0131  putative transmembrane anti-sigma factor  29.17 
 
 		 347 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000144677  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  32.84 
 
 		 253 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  36 
 
 		 336 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  32.31 
 
 		 246 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2804  hypothetical protein  41.46 
 
 		 192 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000109584  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  25.76 
 
 		 278 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2126  putative transmembrane anti-sigma factor  29.58 
 
 		 356 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5341  putative transmembrane anti-sigma factor  30.77 
 
 		 268 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  32.35 
 
 		 266 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>