37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1784 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 300 aa  583  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  93.69 
 
 		 301 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  79.67 
 
 		 300 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  77.48 
 
 		 299 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  77.48 
 
 		 299 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  74.84 
 
 		 297 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  63.61 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  73.53 
 
 		 305 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  63.45 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  63.45 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  63.45 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  61.77 
 
 		 292 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  51.24 
 
 		 322 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  70.82 
 
 		 379 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  70.82 
 
 		 379 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  67.49 
 
 		 383 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  51.6 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  52.05 
 
 		 320 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  42.42 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  44.59 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  44.14 
 
 		 266 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  45.8 
 
 		 228 aa  175  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  36.91 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  34.24 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  38.44 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  36.39 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  36.45 
 
 		 260 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  55.15 
 
 		 253 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  33.45 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  50.38 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  43.83 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  44.27 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  35.76 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1210  anti-sigma factor  41.18 
 
 		 107 aa  45.8  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5261  putative transmembrane anti-sigma factor  29.17 
 
 		 268 aa  43.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1998  putative transmembrane anti-sigma factor  39.33 
 
 		 269 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  29.35 
 
 		 277 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>