38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4006 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 221 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  46.85 
 
 		 278 aa  186  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  47.3 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  62.5 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  46.9 
 
 		 276 aa  164  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  42.18 
 
 		 265 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  61.72 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  43.43 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  55.81 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  50.36 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  42.49 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  43.17 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  45.39 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  48.87 
 
 		 341 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  48.87 
 
 		 341 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  48.87 
 
 		 341 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  48.87 
 
 		 379 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  48.87 
 
 		 383 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  48.87 
 
 		 379 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  48.87 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  40.61 
 
 		 305 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  48.51 
 
 		 300 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  46.27 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  47.41 
 
 		 322 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  47.48 
 
 		 300 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  47.79 
 
 		 297 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  47.79 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  47.79 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  47.37 
 
 		 327 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  38.76 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  44.68 
 
 		 320 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  46.27 
 
 		 301 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  45.93 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  25.52 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  27.49 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2144  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.33 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1813  putative transmembrane anti-sigma factor  36 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000268109  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1737  putative transmembrane anti-sigma factor  34.67 
 
 		 248 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.58191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>