35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6204 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 
299 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 
299 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  95.32 
 
 
297 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  87.09 
 
 
300 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  75.17 
 
 
300 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  74.92 
 
 
301 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  72.55 
 
 
305 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  59.35 
 
 
327 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  59.3 
 
 
341 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  59.3 
 
 
341 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  59.3 
 
 
341 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  49.53 
 
 
322 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  57.97 
 
 
292 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  73.37 
 
 
379 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  73.37 
 
 
379 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  50.83 
 
 
311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  78.29 
 
 
383 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  50.49 
 
 
320 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  43.6 
 
 
266 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  44.55 
 
 
266 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  43.2 
 
 
276 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  46.44 
 
 
228 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  33.67 
 
 
265 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  33.45 
 
 
264 aa  155  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  37.72 
 
 
278 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  35.79 
 
 
260 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.97 
 
 
253 aa  149  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  33.79 
 
 
278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  53.44 
 
 
253 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  48.12 
 
 
274 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  47.79 
 
 
221 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  35.85 
 
 
259 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  41.04 
 
 
276 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0015  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.48 
 
 
503 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348648  hitchhiker  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2144  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.58 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>