47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3435 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 265 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  48.12 
 
 		 278 aa  254  7e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  47.33 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  39.62 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  39.53 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  38.01 
 
 		 264 aa  182  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  40.15 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  56.82 
 
 		 253 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  49.11 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  35.25 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  32.68 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  34.46 
 
 		 266 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  32.65 
 
 		 300 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  35.38 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  44.97 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  47.76 
 
 		 297 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  47.01 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  47.01 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  32.32 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  30.51 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  30.72 
 
 		 320 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  47.69 
 
 		 341 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  47.69 
 
 		 379 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  47.69 
 
 		 341 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  47.69 
 
 		 341 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  47.69 
 
 		 292 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  47.69 
 
 		 383 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  47.69 
 
 		 379 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  41.03 
 
 		 327 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  31.82 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  32.43 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  27.08 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  25.67 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  25.56 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  25.56 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  25.61 
 
 		 329 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4531  putative transmembrane anti-sigma factor  31.76 
 
 		 180 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  25.84 
 
 		 286 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  25.2 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  34.78 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0580  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.43 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1890  hypothetical protein  26.47 
 
 		 78 aa  43.5  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  24.4 
 
 		 286 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  23.4 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  23.17 
 
 		 266 aa  42  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  23.17 
 
 		 266 aa  42  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  32.26 
 
 		 277 aa  42  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>