38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2457 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  100 
 
 
320 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  84.74 
 
 
311 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  53.17 
 
 
322 aa  299  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  54.04 
 
 
300 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  49.42 
 
 
327 aa  258  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  53.8 
 
 
305 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  51.42 
 
 
300 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  51.13 
 
 
297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  50.46 
 
 
299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  50.46 
 
 
299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  45.79 
 
 
341 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  45.79 
 
 
341 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  50.61 
 
 
301 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  45.79 
 
 
341 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  39.51 
 
 
266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  41.25 
 
 
266 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  61.49 
 
 
383 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  61.49 
 
 
379 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  61.49 
 
 
379 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  61.49 
 
 
292 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  40.84 
 
 
276 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  34.62 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  40.32 
 
 
228 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  31.7 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  32.38 
 
 
253 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  31.61 
 
 
278 aa  135  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  34.55 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  46.85 
 
 
253 aa  132  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  45.32 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  44.68 
 
 
221 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  31.86 
 
 
276 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  29.57 
 
 
259 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1210  anti-sigma factor  40.62 
 
 
107 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  35.04 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1890  hypothetical protein  36.76 
 
 
78 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  23.61 
 
 
271 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  22.56 
 
 
276 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.143694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>