37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1898 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 297 aa  587  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  95.32 
 
 		 299 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  95.32 
 
 		 299 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  87.33 
 
 		 300 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  75 
 
 		 300 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  72.7 
 
 		 305 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  74.75 
 
 		 301 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  59.88 
 
 		 327 aa  345  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  61.31 
 
 		 341 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  61.31 
 
 		 341 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  61.31 
 
 		 341 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  50.47 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  60.28 
 
 		 292 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  51.67 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  51.46 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  75.52 
 
 		 379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  75.52 
 
 		 379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  80 
 
 		 383 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  43.55 
 
 		 266 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  44.33 
 
 		 266 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  43.15 
 
 		 276 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  46.84 
 
 		 228 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  34.23 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  34.35 
 
 		 265 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  36.03 
 
 		 260 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  35.56 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  36.59 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  33.68 
 
 		 278 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  53.44 
 
 		 253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  48.12 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  47.79 
 
 		 221 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  41.48 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  29.21 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0015  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.48 
 
 		 503 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348648  hitchhiker  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  31.25 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2144  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.58 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  30.65 
 
 		 286 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>