36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5175 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  100 
 
 
300 aa  589  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  86.67 
 
 
297 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  86.42 
 
 
299 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  86.42 
 
 
299 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  79.67 
 
 
300 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  78.74 
 
 
301 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  74.67 
 
 
305 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  61.28 
 
 
327 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  61.58 
 
 
341 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  61.58 
 
 
341 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  61.58 
 
 
341 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  60.62 
 
 
292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  53.85 
 
 
311 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  71.76 
 
 
379 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  71.76 
 
 
379 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  50 
 
 
322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  52.37 
 
 
320 aa  261  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  68.58 
 
 
383 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  44 
 
 
266 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  45.27 
 
 
276 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  46.02 
 
 
266 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  45.42 
 
 
228 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  35.57 
 
 
264 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  37.04 
 
 
260 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.71 
 
 
253 aa  149  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  37.33 
 
 
278 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  33.56 
 
 
278 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  38.1 
 
 
274 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  54.2 
 
 
253 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  43.56 
 
 
221 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  33.67 
 
 
276 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  30.58 
 
 
259 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1210  anti-sigma factor  41.18 
 
 
107 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1266  anti-sigma factor  38.24 
 
 
107 aa  42.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293532  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0804  hypothetical protein  21.33 
 
 
188 aa  42.4  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>