40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0787 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 
274 aa  549  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  62.78 
 
 
253 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  49.46 
 
 
278 aa  241  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  45.88 
 
 
278 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  43.33 
 
 
264 aa  203  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  40.75 
 
 
265 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  43.68 
 
 
260 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  40 
 
 
253 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  44.65 
 
 
221 aa  161  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  39.25 
 
 
266 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.84 
 
 
300 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  32.6 
 
 
322 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  33.77 
 
 
311 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  37.16 
 
 
300 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  51.88 
 
 
379 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  51.88 
 
 
341 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  51.88 
 
 
383 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  51.88 
 
 
292 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  51.88 
 
 
341 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  51.88 
 
 
379 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  51.88 
 
 
341 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  33.77 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.37 
 
 
320 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  44.51 
 
 
327 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  34.21 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  37.09 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  48.12 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  48.12 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  48.12 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  43.14 
 
 
228 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  48.12 
 
 
301 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  43.17 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  30.74 
 
 
259 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  28.88 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  28.01 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  26.71 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  26.71 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1813  putative transmembrane anti-sigma factor  30.4 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000268109  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3851  putative anti-sigma factor  35.8 
 
 
221 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698758  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  35.71 
 
 
277 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>