60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0889 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 329 aa  663    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2076  putative transmembrane anti-sigma factor  39.47 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000018802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  24.31 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  36.62 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  33.64 
 
 		 146 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  37.14 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  38.24 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0151  putative transmembrane anti-sigma factor  29.46 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0781  putative transmembrane anti-sigma factor  35.38 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1326  hypothetical protein  31.88 
 
 		 465 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000243968  hitchhiker  0.00621187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0334  putative transmembrane anti-sigma factor  35.71 
 
 		 79 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0219633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3851  putative anti-sigma factor  24.78 
 
 		 221 aa  52.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0245  putative transmembrane anti-sigma factor  30.61 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2147  hypothetical protein  26.14 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  27.73 
 
 		 318 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1893  putative transmembrane anti-sigma factor  35.29 
 
 		 212 aa  50.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.88 
 
 		 376 aa  49.7  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  27.12 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3621  putative transmembrane anti-sigma factor  30.77 
 
 		 89 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0680768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  25.61 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  34.78 
 
 		 390 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  34.69 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  27.03 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  34.85 
 
 		 255 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3940  putative transmembrane anti-sigma factor  42.5 
 
 		 292 aa  46.6  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000279059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3615  putative transmembrane anti-sigma factor  29.41 
 
 		 393 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0892578  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  30.77 
 
 		 371 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2225  hypothetical protein  31.51 
 
 		 91 aa  46.6  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  24.03 
 
 		 259 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4156  putative transmembrane anti-sigma factor  28.21 
 
 		 366 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0909715  hitchhiker  0.000583924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2572  hypothetical protein  30.56 
 
 		 103 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3810  hypothetical protein  46.15 
 
 		 81 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  34.04 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  28.74 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0786  putative transmembrane anti-sigma factor  51.35 
 
 		 386 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4280  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0890457  normal  0.0241323 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1022  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3107  hypothetical protein  24.82 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445247  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  44.74 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3132  putative transmembrane anti-sigma factor  40 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  44.74 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2732  hypothetical protein  31.19 
 
 		 200 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  44.74 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1555  putative transmembrane anti-sigma factor  32.84 
 
 		 81 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0444542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3577  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.14 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.427152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9375  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.09 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0155  putative transmembrane anti-sigma factor  24.35 
 
 		 203 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000067167  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2792  hypothetical protein  30.88 
 
 		 87 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  25.3 
 
 		 250 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0333  putative transmembrane anti-sigma factor  36.73 
 
 		 93 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0049  hypothetical protein  29.73 
 
 		 88 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1520  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.03 
 
 		 255 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2249  putative transmembrane anti-sigma factor  36.36 
 
 		 412 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2694  hypothetical protein  27.4 
 
 		 94 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2570  hypothetical protein  30.88 
 
 		 86 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3287  putative transmembrane anti-sigma factor  31.91 
 
 		 273 aa  42.7  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  27.68 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  27.5 
 
 		 247 aa  42.7  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11370  hypothetical protein  22.3 
 
 		 371 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3099  hypothetical protein  45 
 
 		 145 aa  42.4  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000453885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>