30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2037 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 313 aa  628  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  74.29 
 
 		 318 aa  467  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0897  putative transmembrane anti-sigma factor  36.24 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0263954  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4651  putative transmembrane anti-sigma factor  28.87 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.202977  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0245  putative transmembrane anti-sigma factor  30.49 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  31.93 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  27.93 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  23.93 
 
 		 329 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  39.56 
 
 		 276 aa  49.3  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1520  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.84 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.78 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  45.65 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0939  putative transmembrane anti-sigma factor  29.09 
 
 		 220 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  31.88 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  29.03 
 
 		 390 aa  46.6  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  37.08 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  42.55 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  36.26 
 
 		 244 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  32.86 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0580  anti-ECFsigma factor, ChrR  24.85 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3615  putative transmembrane anti-sigma factor  24.05 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0892578  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  40.98 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0351  putative transmembrane anti-sigma factor  33.64 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0304335 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  42 
 
 		 223 aa  43.5  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1326  hypothetical protein  44.74 
 
 		 465 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000243968  hitchhiker  0.00621187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  34.57 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  31.34 
 
 		 214 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  25.5 
 
 		 336 aa  42.7  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.28 
 
 		 690 aa  42.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>