24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0347 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  34.77 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1906  hypothetical protein  33.11 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4472  hypothetical protein  33 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1908  hypothetical protein  32.26 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.194479  normal  0.142642 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2946  hypothetical protein  34.39 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00896315  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  26.76 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  36.56 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  25.81 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3578  hypothetical protein  23.81 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  39.56 
 
 		 313 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4651  putative transmembrane anti-sigma factor  25.84 
 
 		 263 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.202977  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0899  hypothetical protein  34.67 
 
 		 155 aa  48.9  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  24.38 
 
 		 255 aa  49.3  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0625  Anti-sigma K factor RskA  41.27 
 
 		 206 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.793553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  31.18 
 
 		 276 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0900  hypothetical protein  26.49 
 
 		 159 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  31.76 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  33.85 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3520  hypothetical protein  36.67 
 
 		 172 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  34.92 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1665  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  42.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  23.13 
 
 		 258 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>